Equipements

L’originalité de la plateforme GENTYANE réside dans le fait de disposer d’un ensemble cohérent d’équipements et d'infrastructures permettant d’offrir une gamme large et diversifiée de services, nous permettant de traiter des projets de toutes tailles en répondant avec des outils et des technologies adaptés aux demandes scientifiques.

Nous disposons pour ce faire, d'une gamme de Q-PCR standard ou en micro fluidique, nous permettant de génotyper de 1 à 96 SNP sur au moins 96 génotypes, et de 2 GeneTitan Axiom (unique en prestation en France, robotisée unique en Europe permettant un débit de production de 16 plaques 96 ou 384 soit un milliard de données par semaine) permettant de génotyper de 1500 à plusieurs millions de SNP sur un minimum de 480 génotypes. Nous sommes l'unique plateforme en France à proposer cette gamme étendue de technologie et de savoir faire. Par ailleurs, depuis juillet 2021, nous proposons une solution de génotypage de débit intermédiaire, génotypage par séquençage (GBS) AgriSeq Thermo. Cette solution est adaptée pour des besoins de génotypage de plusieurs milliers d'échantillons avec 300 à 3000 SNP. 

Concernant le séquençage à ultra haut débit, nous avons fait le choix de rester dans la production de données NGS longs fragments (2 séquenceurs Pacific Biosciences Revio et Sequel II). Nous sommes Service Provider certifié par Pacific Biosciences en France. Ce choix a été motivé par la volonté d’être complémentaire et non concurrent de nos collègues des plateformes de l'Infrastructure INRAE Genomics (GeT de Toulouse dirigée par Cécile Donnadieu, EPGV d'Évry dirigée par Patricia Faivre Rampant et PGTB de Bordeaux dirigée par Olivier Lepais).

Concernant la carte optique, nous sommes service provider France pour Bionano Genomics et possédons 3 Saphyr. Nous avons la chance d'accueillir sur Gentyane, Michaela WEST, FAS Bionano Genomics et bénéficier de son expertise.

Nous accompagnons nos clients, depuis la définition de leurs besoins et les stratégies à mettre en œuvre, jusqu'à l'exécution de la prestation. Nous recevons nos clients pour les former à l'analyse de leurs données.