Hybridation sur Axiom

La technologie de génotypage Axiom Thermofisher est une technologie basée sur l'hybridation sur puce. Elle permet le génotypage de marqueur SNP à ultra haut débit. Elle permet également d'automatiser la préparation des puces.

• Type de projet :
  Technologie adaptée à partir de 3000 SNP à plusieurs millions de SNP  sur au minimum 480 génotypes.
• Echantillon :
  nécessite 100µl à 50 ng/µl, ADN de haut poids moléculaire (90% > à 10Kb), dosage Picogreen ou Hoechst, pas d'ARN, ratio DO 260/280 entre 1,8 et 2 et ratio DO 260/230 supérieur à 1,5.
• Support :
  Axiom Array (96, mini 96 et 384 génotypes, jusqu’à 700000 SNP en 96 et jusqu’à 70000 SNP en 384). Matériel utilisé : Beckman Coulter® Biomek® FxPSpan8 Thermocycleurs Applied Biosystems® Veriti™ 96 GeneTitan MC Instrument.
• Possibilité de puce Axiom multi-espèces
• Débit :
  5 Arrays Plates par semaine par Genetitan soit 624 000 000 données par semaine.
• Logiciel d’exploitation des résultats :
  Axiom Analysis Suite